ESTUDIO BIOINFORMÁTICO SOBRE EL GEN LACZ DE PSEUDOALTEROMONAS HALOPLANKTIS
ÍNDICE
1. Introducción: Características generales del gen lacZ, de la proteína codificada, del proceso biotecnológico al que se asocia y de la enfermedad relacionada.
1.1. Objetivos del trabajo
1.2. Elección del gen
1.3. Biología de Pseudoalteromonas haloplanktis
1.4. Características biológicas y catalíticas de la proteina lacZ
1.5. Proceso biotecnológico asociado
1.6. Enfermedad causante del nacimiento del proceso biotecnológico
2. Materiales y métodos: Compendio de bases de datos, programas y aplicaciones web utilizadas en los estudios. 2.1. Bases de datos
2.1.1. UniProt
2.1.2. GeneBank
2.1.3. Pfam
2.1.4. InterPro y Prosite
2.1.5. PDB
2.1.6. CATH
2.1.7. ArrayExpress
2.2. Software bioinformáticas
2.2.1. BLAST
2.2.2. Bioedit Sequence Alignment Editor
2.2.3. ClustalX
2.2.4. TreeView 2.2.5. Rasmol
3. Resultados y discusión: Resultados de los análisis y discusión de los resultados obtenidos.
3.1. Búsqueda de secuencias de lacZ de Pseudoalteromonas haloplanktis y homólogos en bases de datos moleculares
3.2. Búsqueda de secuencias homólogas usando la herramienta de búsqueda de similitud BLAST
3.3. Análisis del CDS de nuestra proteína por medio de matrices de puntos
3.4. Alineamientos múltiples y filogenia
3.4.1. Alineamientos de secuencias aminoacídicas
3.4.2. Árboles filogenéticos
3.4.3. Matrices de distancia
3.5. Búsqueda de dominios y motivos conservados en nuestra proteína de estudio 3.6. Estructura tridimensional de la proteína de estudio
3.7. Análisis de la expresión génica de la proteína de referencia
4. Conclusiones: Implicaciones de los resultados obtenidos en el estudio, de forma esquemática.
5. Bibliografía
6. Aportaciones al trabajo
Grupo Introducción Material y Métodos Resultados Discusión Conclusiones Aspecto global Aportaciones wiki Autoevaluación NOTA FINAL
11 0,45 0,95 1,95 2,4 0,9 0,5 2 0,5 96,50
ÍNDICE
1. Introducción: Características generales del gen lacZ, de la proteína codificada, del proceso biotecnológico al que se asocia y de la enfermedad relacionada.
1.1. Objetivos del trabajo
1.2. Elección del gen
1.3. Biología de Pseudoalteromonas haloplanktis
1.4. Características biológicas y catalíticas de la proteina lacZ
1.5. Proceso biotecnológico asociado
1.6. Enfermedad causante del nacimiento del proceso biotecnológico
2. Materiales y métodos: Compendio de bases de datos, programas y aplicaciones web utilizadas en los estudios. 2.1. Bases de datos
2.1.1. UniProt
2.1.2. GeneBank
2.1.3. Pfam
2.1.4. InterPro y Prosite
2.1.5. PDB
2.1.6. CATH
2.1.7. ArrayExpress
2.2. Software bioinformáticas
2.2.1. BLAST
2.2.2. Bioedit Sequence Alignment Editor
2.2.3. ClustalX
2.2.4. TreeView
2.2.5. Rasmol
3. Resultados y discusión: Resultados de los análisis y discusión de los resultados obtenidos.
3.1. Búsqueda de secuencias de lacZ de Pseudoalteromonas haloplanktis y homólogos en bases de datos moleculares
3.2. Búsqueda de secuencias homólogas usando la herramienta de búsqueda de similitud BLAST
3.3. Análisis del CDS de nuestra proteína por medio de matrices de puntos
3.4. Alineamientos múltiples y filogenia
3.4.1. Alineamientos de secuencias aminoacídicas
3.4.2. Árboles filogenéticos
3.4.3. Matrices de distancia
3.5. Búsqueda de dominios y motivos conservados en nuestra proteína de estudio
3.6. Estructura tridimensional de la proteína de estudio
3.7. Análisis de la expresión génica de la proteína de referencia
4. Conclusiones: Implicaciones de los resultados obtenidos en el estudio, de forma esquemática.
5. Bibliografía
6. Aportaciones al trabajo
Grupo Introducción Material y Métodos Resultados Discusión Conclusiones Aspecto global Aportaciones wiki Autoevaluación NOTA FINAL
11 0,45 0,95 1,95 2,4 0,9 0,5 2 0,5 96,50